如何安装 libbamtools-dev Debian 10

了解如何安装 libbamtools-dev Debian 10 通过本教程。 libbamtools-dev 是用于操作 BAM(基因组比对)文件的 C++ API

介绍

在本教程中我们学习如何安装 libbamtools-dev 在 Debian 10.

什么是 libbamtools-dev

libbamtools-dev 是:

BamTools 使用 BAM 文件促进研究分析和数据管理。 它可以处理当前测序技术产生的大量数据,这些数据通常以压缩的二进制格式存储,而生物信息学研究中常用的基于文本的解析器不容易处理这些数据。

BamTools 提供用于 BAM 文件支持的 C++ API 以及命令行工具包。

这是开发者 API 包。

有三种安装方法 libbamtools-dev 在 Debian 10.我们可以使用 apt-get, aptaptitude。 在以下部分中,我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。

更新 apt 数据库 apt-get 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 libbamtools-dev 使用 apt-get 通过运行以下命令:

sudo apt-get -y install libbamtools-dev

更新 apt 数据库 apt 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 libbamtools-dev 使用 apt 通过运行以下命令:

sudo apt -y install libbamtools-dev

如果您想遵循此方法,您可能需要先安装 aptitude,因为 aptitude 通常不会默认安装 Debian。 更新 apt 数据库 aptitude 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 libbamtools-dev 使用 aptitude 通过运行以下命令:

sudo aptitude -y install libbamtools-dev

仅卸载 libbamtools-dev 打包我们可以使用以下命令:

sudo apt-get remove libbamtools-dev

卸载 libbamtools-dev 及其依赖项

卸载 libbamtools-dev 及其不再需要的依赖项 Debian 10、我们可以使用下面的命令:

sudo apt-get -y autoremove libbamtools-dev

删除 libbamtools-dev 配置和数据

去除 libbamtools-dev 配置和数据来自 Debian 10.我们可以使用如下命令:

sudo apt-get -y purge libbamtools-dev

删除 libbamtools-dev 配置、数据及其所有依赖项

我们可以使用下面的命令来删除 libbamtools-dev 配置、数据及其所有依赖项,我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y autoremove --purge libbamtools-dev

依赖关系

libbamtools-dev 具有以下依赖项:

参考

概括

在本教程中我们学习如何安装 libbamtools-dev 封装在 Debian 10. 使用不同的包管理工具: apt, apt-getaptitude