在本教程中,我们学习如何安装大蒜 Ubuntu 18.04。 大蒜是生物分子的可视化程序
介绍
在本教程中我们学习如何安装 garlic
在 Ubuntu 18.04。
什么是 garlic
大蒜是:
大蒜是为研究膜蛋白而编写的。 它可用于可视化其他蛋白质以及一些几何物体。 此版本的大蒜可识别 PDB 格式版本 2.1。 大蒜也可用于分析蛋白质序列。
它只依赖于X库,不需要其他库。
特点包括:
- 板的位置和厚度在小窗口中可见。
- 原子键和原子被视为独立的可绘制对象。
- 原子和键的颜色取决于位置。 有五种映射模式可用(对于平板)。
- 能够显示立体图像。
- 能够显示其他几何对象,例如膜。
- 原子信息可用于鼠标指针覆盖的原子。 无需点击,只需将鼠标指针移到结构上即可!
- 能够加载多个结构。
- 能够绘制拉马钱德兰图、螺旋轮、维恩图、平均疏水性和疏水矩图。
- 命令提示符位于主窗口底部。 它能够显示一条错误消息和一条命令字符串。
有三种安装方法 garlic
在 Ubuntu 18.04。 我们可以用 apt-get
, apt
和 aptitude
。 在以下部分中,我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。
使用 apt-get 安装大蒜
更新 apt 数据库 apt-get
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 garlic
使用 apt-get
通过运行以下命令:
sudo apt-get -y install garlic
使用 apt 安装大蒜
更新 apt 数据库 apt
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 garlic
使用 apt
通过运行以下命令:
sudo apt -y install garlic
使用 aptitude 安装大蒜
如果您想遵循此方法,您可能需要先安装 aptitude,因为 aptitude 通常不会默认安装 Ubuntu。 更新 apt 数据库 aptitude
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 garlic
使用 aptitude
通过运行以下命令:
sudo aptitude -y install garlic
如何卸载大蒜 Ubuntu 18.04
仅卸载 garlic
打包我们可以使用以下命令:
sudo apt-get remove garlic
卸载大蒜及其依赖项
卸载 garlic
及其不再需要的依赖项 Ubuntu 18.04,我们可以使用以下命令:
sudo apt-get -y autoremove garlic
删除大蒜配置和数据
去除 garlic
配置和数据来自 Ubuntu 18.04我们可以使用以下命令:
sudo apt-get -y purge garlic
删除大蒜配置、数据及其所有依赖项
我们可以使用下面的命令来删除 garlic
配置、数据及其所有依赖项,我们可以使用以下命令:
sudo apt-get -y autoremove --purge garlic
参考
概括
在本教程中我们学习如何安装 garlic
封装在 Ubuntu 18.04 使用不同的包管理工具: apt
, apt-get
和 aptitude
。