在本教程中，我们学习如何安装 cutadapt Ubuntu 18.04。 cutadapt 是从高通量测序读取中清理生物序列
介绍
在本教程中我们学习如何安装 cutadapt 在 Ubuntu 18.04。
什么是 cutadapt
切适应是：
Cutadapt 通过以容错方式查找接头或引物序列来帮助完成生物序列清理任务。 它还可以以各种方式修改和过滤读数。 适配器序列可以包含 IUPAC 通配符。 此外，还支持双端读取，甚至支持色彩空间数据。 如果需要，您也可以只对输入数据进行多路分解，而根本不删除适配器序列。
该包包含用户界面。
有三种安装方法 cutadapt 在 Ubuntu 18.04。 我们可以用 apt-get, apt 和 aptitude。 在以下部分中，我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。
使用 apt-get 安装 cutadapt
更新 apt 数据库 apt-get 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 cutadapt 使用 apt-get 通过运行以下命令：
sudo apt-get -y install cutadapt
使用 apt 安装 cutadapt
更新 apt 数据库 apt 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 cutadapt 使用 apt 通过运行以下命令：
sudo apt -y install cutadapt
使用 aptitude 安装 cutadapt
如果您想遵循此方法，您可能需要先安装 aptitude，因为 aptitude 通常不会默认安装 Ubuntu。 更新 apt 数据库 aptitude 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 cutadapt 使用 aptitude 通过运行以下命令：
sudo aptitude -y install cutadapt
如何卸载 cutadapt Ubuntu 18.04
仅卸载 cutadapt 打包我们可以使用以下命令：
sudo apt-get remove cutadapt
卸载 cutadapt 及其依赖项
卸载 cutadapt 及其不再需要的依赖项 Ubuntu 18.04，我们可以使用以下命令：
sudo apt-get -y autoremove cutadapt
删除 cutadapt 配置和数据
去除 cutadapt 配置和数据来自 Ubuntu 18.04我们可以使用以下命令：
sudo apt-get -y purge cutadapt
删除 cutadapt 配置、数据及其所有依赖项
我们可以使用下面的命令来删除 cutadapt 配置、数据及其所有依赖项，我们可以使用以下命令：
sudo apt-get -y autoremove --purge cutadapt
参考
概括
在本教程中我们学习如何安装 cutadapt 封装在 Ubuntu 18.04 使用不同的包管理工具： apt, apt-get 和 aptitude。
