如何安装 cluster3 Ubuntu 18.04

在本教程中,我们学习如何安装 cluster3 Ubuntu 18.04。 cluster3 是 Eisen 集群软件的重新实现

介绍

在本教程中我们学习如何安装 cluster3 在 Ubuntu 18.04。

什么是 cluster3

集群3是:

此处提供的开源聚类软件包含可用于分析基因表达数据的聚类例程。 包括分层(成对简单、完整、平均和质心链接)聚类、k 均值和 k 中值聚类以及 2D 自组织图的例程。 这些例程以 C 聚类库、Python 扩展模块、Perl 模块以及 Cluster 的增强版本(最初由伯克利实验室的 Michael Eisen 开发)的形式提供。 C 集群库和相关的 Python 扩展模块是在 Python 许可证下发布的。 Perl 模块是在 Artistic License 下发布的。 Cluster 3.0 包含在原始 Cluster/TreeView 许可证中。

该软件包仅包含 Cluster 3.0 的命令行和主题 GUI 版本。

有三种安装方法 cluster3 在 Ubuntu 18.04。 我们可以用 apt-get, aptaptitude。 在以下部分中,我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。

使用 apt-get 安装 cluster3

更新 apt 数据库 apt-get 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 cluster3 使用 apt-get 通过运行以下命令:

sudo apt-get -y install cluster3

使用 apt 安装 cluster3

更新 apt 数据库 apt 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 cluster3 使用 apt 通过运行以下命令:

sudo apt -y install cluster3

使用 aptitude 安装 cluster3

如果您想遵循此方法,您可能需要先安装 aptitude,因为 aptitude 通常不会默认安装 Ubuntu。 更新 apt 数据库 aptitude 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 cluster3 使用 aptitude 通过运行以下命令:

sudo aptitude -y install cluster3

如何卸载 cluster3 Ubuntu 18.04

仅卸载 cluster3 打包我们可以使用以下命令:

sudo apt-get remove cluster3

卸载 cluster3 及其依赖项

卸载 cluster3 及其不再需要的依赖项 Ubuntu 18.04,我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y autoremove cluster3

删除 cluster3 配置和数据

去除 cluster3 配置和数据来自 Ubuntu 18.04我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y purge cluster3

删除 cluster3 配置、数据及其所有依赖项

我们可以使用下面的命令来删除 cluster3 配置、数据及其所有依赖项,我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y autoremove --purge cluster3

参考

概括

在本教程中我们学习如何安装 cluster3 封装在 Ubuntu 18.04 使用不同的包管理工具: apt, apt-getaptitude