了解如何安装bitseq Debian 10 通过本教程。 bitseq 是根据测序数据对转录本进行贝叶斯推理
介绍
在本教程中我们学习如何安装 bitseq
在 Debian 10.
什么是 bitseq
位序是:
BitSeq 是一款用于从测序 (RNA-Seq) 数据推断单个转录本的表达水平并估计条件之间的差异表达 (DE) 的应用程序。 这种方法的优点是能够考虑技术不确定性和内在生物学差异,以避免错误的 DE 调用。 技术上对不确定性的贡献既来自于有限的读取深度,也来自于读取到多个转录本的可能不明确的映射。
有三种安装方法 bitseq
在 Debian 10.我们可以使用 apt-get
, apt
和 aptitude
。 在以下部分中,我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。
使用 apt-get 安装 Bitseq
更新 apt 数据库 apt-get
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 bitseq
使用 apt-get
通过运行以下命令:
sudo apt-get -y install bitseq
使用 apt 安装 Bitseq
更新 apt 数据库 apt
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 bitseq
使用 apt
通过运行以下命令:
sudo apt -y install bitseq
使用 aptitude 安装bitseq
如果您想遵循此方法,您可能需要先安装 aptitude,因为 aptitude 通常不会默认安装 Debian。 更新 apt 数据库 aptitude
使用以下命令。
更新apt数据库后,我们可以安装 bitseq
使用 aptitude
通过运行以下命令:
sudo aptitude -y install bitseq
如何卸载bitseq Debian 10
仅卸载 bitseq
打包我们可以使用以下命令:
sudo apt-get remove bitseq
卸载bitseq及其依赖项
卸载 bitseq
及其不再需要的依赖项 Debian 10、我们可以使用下面的命令:
sudo apt-get -y autoremove bitseq
删除bitseq配置和数据
去除 bitseq
配置和数据来自 Debian 10.我们可以使用如下命令:
sudo apt-get -y purge bitseq
删除bitseq配置、数据及其所有依赖项
我们可以使用下面的命令来删除 bitseq
配置、数据及其所有依赖项,我们可以使用以下命令:
sudo apt-get -y autoremove --purge bitseq
依赖关系
Bitseq 具有以下依赖关系:
参考
概括
在本教程中我们学习如何安装 bitseq
封装在 Debian 10. 使用不同的包管理工具: apt
, apt-get
和 aptitude
。