如何安装bustools Ubuntu 22.04

在本教程中,我们学习如何安装bustools Ubuntu 22.04。 Bustools 是用于操作单细胞 RNA-Seq 数据集的 BUS 文件的程序

介绍

在本教程中我们学习如何安装 bustools 在 Ubuntu 22.04。

什么是 bustools

巴士工具是:

该软件包包含 BUStools 程序,可用于纠错条形码、折叠 UMI、生成基因计数或转录兼容性计数矩阵

有三种安装方法 bustools 在 Ubuntu 22.04。 我们可以用 apt-get, aptaptitude。 在以下部分中,我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。

更新 apt 数据库 apt-get 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 bustools 使用 apt-get 通过运行以下命令:

sudo apt-get -y install bustools

更新 apt 数据库 apt 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 bustools 使用 apt 通过运行以下命令:

sudo apt -y install bustools

如果您想遵循此方法,您可能需要先安装 aptitude,因为 aptitude 通常不会默认安装 Ubuntu。 更新 apt 数据库 aptitude 使用以下命令。

更新apt数据库后,我们可以安装 bustools 使用 aptitude 通过运行以下命令:

sudo aptitude -y install bustools

仅卸载 bustools 打包我们可以使用以下命令:

sudo apt-get remove bustools

卸载bustools及其依赖项

卸载 bustools 及其不再需要的依赖项 Ubuntu 22.04,我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y autoremove bustools

删除bustools配置和数据

去除 bustools 配置和数据来自 Ubuntu 22.04我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y purge bustools

删除bustools配置、数据及其所有依赖项

我们可以使用下面的命令来删除 bustools 配置、数据及其所有依赖项,我们可以使用以下命令:

sudo apt-get -y autoremove --purge bustools

参考

概括

在本教程中我们学习如何安装 bustools 封装在 Ubuntu 22.04 使用不同的包管理工具: apt, apt-getaptitude