了解如何安装 samtools Debian 10 通过本教程。 samtools 正在处理 SAM、BAM 和 CRAM 格式的序列比对
介绍
在本教程中我们学习如何安装 samtools 在 Debian 10.
什么是 samtools
萨姆工具是：
Samtools 是一组以二进制 BAM 格式操作核苷酸序列比对的实用程序。 它可以导入和导出 ascii SAM（序列比对/映射）和 CRAM 格式，进行排序、合并和索引，并允许快速检索任何区域中的读数。 它被设计为在流上工作，并且能够在远程 FTP 或 HTTP 服务器上打开 BAM 或 CRAM（不是 SAM）文件。
有三种安装方法 samtools 在 Debian 10.我们可以使用 apt-get, apt 和 aptitude。 在以下部分中，我们将描述每种方法。 您可以选择其中之一。
更新 apt 数据库 apt-get 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 samtools 使用 apt-get 通过运行以下命令：
sudo apt-get -y install samtools
更新 apt 数据库 apt 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 samtools 使用 apt 通过运行以下命令：
sudo apt -y install samtools
如果您想遵循此方法，您可能需要先安装 aptitude，因为 aptitude 通常不会默认安装 Debian。 更新 apt 数据库 aptitude 使用以下命令。
更新apt数据库后，我们可以安装 samtools 使用 aptitude 通过运行以下命令：
sudo aptitude -y install samtools
仅卸载 samtools 打包我们可以使用以下命令：
sudo apt-get remove samtools
卸载 samtools 及其依赖项
卸载 samtools 及其不再需要的依赖项 Debian 10、我们可以使用下面的命令：
sudo apt-get -y autoremove samtools
删除 samtools 配置和数据
去除 samtools 配置和数据来自 Debian 10.我们可以使用如下命令：
sudo apt-get -y purge samtools
删除 samtools 配置、数据及其所有依赖项
我们可以使用下面的命令来删除 samtools 配置、数据及其所有依赖项，我们可以使用以下命令：
sudo apt-get -y autoremove --purge samtools
依赖关系
samtools 具有以下依赖项：
参考
概括
在本教程中我们学习如何安装 samtools 封装在 Debian 10. 使用不同的包管理工具： apt, apt-get 和 aptitude。
